微生物RNA生物学实验室

简介 人体微生物学+RNA生物学

分享到
实验室简介

       中国科学院上海巴斯德研究所是由中国科学院和法国巴斯德研究所(Institut Pasteur)共建的国际化研究机构,聚焦病原微生物基本生命活动规律、重大传染性疾病的致病机制等关键科学问题,开展基础与转化型研究,服务全球公共健康。上海巴斯德研究所具有完善的病原生物学、免疫学、疫苗学学科布局,拥有先进的科研装备与设施,是活跃在全球传染病防控领域的一支重要力量,是国际高端人才引进、一带一路科技合作与人才培养的重要基地和窗口。

        课题组长晁彦杰博士于2020年10月回国加入中国科学院上海巴斯德研究所、健康发育与微生物学国际研究中心(CMDH),任研究员、课题组长、博士生导师,入选国家海外高层次人才、中科院百人计划、上海市海外高层次人才计划等,现主持国家重点研发计划国际合作项目、国家重点研发计划十四五项目子课题、国家自然科学基金面上项目、中科院国合局重点项目、上海市自然科学基金等多个科研项目。在Nature, Molecular Cell, EMBO J, EMBO Mol Medicine, PNAS等杂志发表多篇高影响力论文,受到杂志点评和F1000prime专家推荐,累计引用超过6000次。兼任BMC Genomics等多家杂志编委,EMBO J、NAR、mBio等30多家领域权威期刊的审稿专家。

        晁彦杰博士毕业于德国洪堡大学/马普感染生物学研究所,2014-2016在德国维尔茨堡大学、德国与欧盟科学院院士Jörg Vogel实验室进行博士后研究,2016-2020在美国HHMI/塔夫茨大学进行博士后研究。长期从事病原微生物学和非编码RNA方向的研究,目标为阐释微生物基因表达和调节的分子机制,了解人体共生微生物和病原性细菌定植和感染的过程和机理。通过开发和利用先进的高通量测序技术和系统生物学分析方法,近年来发现并详细鉴定了一类新型的非编码小RNA(来自于细菌信使mRNA的3'非翻译区),致力于对此类小RNA的产生机制和微生物中的RNA代谢过程进行系统性地深入探索。另外,晁彦杰博士参与的RNA工作在细菌中首次发现了II型CRISPR-Cas9免疫防御系统,基于该系统开发的Cas9基因编辑工具革命性地推动了真核生物的基因组编辑,获得了2020年诺贝尔化学奖的认可。

 

       目前本实验室有多个博后和科研助理职位空缺,常年招收实习生与研究生,欢迎对微生物RNA研究感兴趣的博士、硕士、联合培养研究生申请加入实验室,生信分析/实验均可!(申请方法与职位详情参见中科院巴斯德所招聘信息页1招聘信息页2,或通过电子邮件直接联系PI)

关键词:病原微生物,人体微生物,非编码RNA,RNA互作组,RNA结合蛋白,RNA测序,Tn-seq,细胞膜稳态调节

英文网站:https://yanjiechao.wordpress.com

上海巴斯德研究所:http://www.ips.ac.cn

 

相关新闻报道:

【文汇报】博士期间参与诺奖成果奠基性实验,这个中国小伙完成了“基因剪刀”关键一环

【解放日报-上海观察】“基因剪刀”的两个“刀把”是怎样发现的?他是直接参与该研究的中国人

【新华网】 晁彦杰:第三代“基因剪刀”CRISPR较前两代技术更具优势

【新华网】“解读科学类诺贝尔奖系列讲坛”第三场开讲

【看看新闻】晁彦杰解读2020年诺贝尔化学奖视频资料

人体微生物的RNA系统生物学研究

本课题组主要开展人体共生细菌和病原性细菌的定植、致病与耐药过程和机制研究,利用单细胞测序,RNA测序,RNA互作组测序,CLIP-seq,Tn-Seq合成生物学等先进手段分析微生物基因表达调控,mRNA转录加工,非编码RNA调节机制,新型RNA结合蛋白质的鉴定与功能等研究工作。

阅读更多